A miRNS-106b-5p és a TRAIL génexpressziójának elemzése az apoptózis útjában a gyomorrákban

Két százalékos etidium-bromiddal festett agarózgél, amelyen H. pylori PCR-termékek (150 bp) találhatók, hogy a H. pylori-t azonosítsák normál gyomornyálkahártyával (1-3), gyomorhurutban (4-7) és gyomorrákban szenvedő betegek gyomorbiopsziás mintáiban. (8–11). Vizet használtunk negatív kontrollként; pozitív kontrollként tenyészetből származó H. pylori DNS-t használtunk. A megközelítőleg 1200 bp sáv egy nem specifikus sáv, nem kapcsolódik a H. pylori-hoz.

mirns-106b-5p

A TNF-rel kapcsolatos apoptózist indukáló ligandum (TRAIL) génexpressziójának elemzése a Control, a Gastritis és a Cancer csoportokban, figyelembe véve azokat a betegeket, amelyek pozitívak és negatívak voltak H. pylori fertőzés szempontjából minden csoportban. * statisztikailag szignifikáns.

A TRAIL gén expressziójának elemzése a H. pylori jelenlétére a Control, a Gastritis és a Cancer csoportokban. Jelmagyarázat: Neg.: Negatív; Poz.: Pozitív. * statisztikailag szignifikáns.

A miR-106b-5p génexpresszió elemzése, figyelembe véve a H. pylori jelenlétét a kontroll, gasztritisz és rák csoportokban, valamint a miR-106b-5p gén expressziójának elemzése H. pylori jelenlétével. Jelmagyarázat: Neg.: Negatív; Poz.: Pozitív. * statisztikailag szignifikáns és a p-értékeket a 3. táblázat mutatja .

Citoszcape elemzés a TRAIL és a miR-106b-5p figyelembevételével az apoptózis útvonalán. (A) Validált miRNS-ek, amelyek kölcsönhatásba lépnek a TRAIL (TNFSF10) génnel. (B) Megjósolt miRNS-ek, amelyek TRAIL-t (TNFSF10) tartalmaznak célgénként. (C) miR-106b-5p-vel szabályozott validált gének. (D) Megjósolt gének, amelyeket miR-106b-5p szabályoz.

A vulkán-ábrák (GSE33651 és GSE103236) megmutatták a gyomorrák minták és a normál minták közötti differenciálisan expresszált géneket (DEG).

A GSE33651 és a GSE103236 adatkészletek közötti átfedéseket ábrázoló Venn-diagramok. (A) A lefelé szabályozott gének átfedését szemléltető Venn-diagramok. (B) Venn-diagramok, amelyek a szabályozott gének átfedését szemléltetik.